سیدمحمدخاتمی با صدورپیامی در گذشت آیت الله العظمی منتظری را تسلیت گفت. متن کامل این پیام بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
هو الباقی!
رحلت عالم زاهد ومجتهد والاقدر؛مجاهد نستوه؛فقیه، کلامی ، جامع معقول و منقول حضرت آیت الله العظمی منتظری رضوان اله علیه را به ساحت مبارک حضرت ولی الله الاعظم ؛به حوزه های علمیه؛به همه ارادتمندان؛دوستداران آن فقید سعید و بیت شریف و بستگان و فرزندان محترمشان از صمیم قلب تسلیت عرض میکنم.
عالم و متفکر و فقیه بزرگواری رخ در نقاب خاک کشید که در عرصه علم و عمل همه عمر پر برکت خود را در مسیری که رضایت خداوند را در آن می دانست مصروف کرد و برای خدا و خدمت به بندگان او و دفاع از میهن و مردم؛رنجها؛دربدریها و زندانها و شکنجهها را با سینهای گشاده تحمل کرد و عزیزترین سرمایهاش یعنی فرزند عزیز و مجاهدش حجهالاسلام والمسلمین محمد منتظری را نیز تقدیم انقلاب و راه خدا کرد.
آن بزرگ از ارادتمندان حضرت امام و از سردمداران و پایه های انقلاب بزرگی بود که به رهبری ممتاز حضرت امام بالمال به پیروزی رسید.
بدون تردید فقدان این عالم ربانی برای اسلام و تشیع و بخصوص حوزههای علمیه خسارتی بزرگ است و از خدا میخواهم که آنرا به لطف بیکران خود جبران نماید و روان پاک این عزیز را در بحبوحه رضوان و بهشت خود متنعم گرداند.
